Ceppi genetici di HIV-1 e HIV-2

Uno degli ostacoli principali al trattamento o allo sviluppo di un vaccino efficace per l'HIV è l'elevata diversità genetica del virus stesso. Mentre i virus che usano il DNA a doppio filamento per replicare sono relativamente stabili, i retrovirus come l'HIV vanno indietro nel loro ciclo di replicazione (usando l'RNA a singolo ceppo) e sono molto meno stabili. Di conseguenza, l'HIV è molto incline a mutare la mutazione, infatti, circa un milione di volte più frequentemente rispetto alle cellule che usano il DNA.
Con l'allargarsi della diversità genetica del virus e il passaggio di diversi sottotipi virali da persona a persona, il materiale genetico misto può creare nuovi ibridi HIV. Mentre la maggior parte di questi ibridi muore, i pochi sopravvissuti mostrano spesso una maggiore resistenza alla terapia anti-HIV e, in alcuni casi, una più rapida progressione della malattia.
La variabilità dell'HIV, quindi, crea qualcosa di "bersaglio mobile" per i ricercatori, con nuovi ceppi ricombinanti (genetici combinati) in grado di resistere o del tutto eludere agenti neutralizzanti. Alcuni, come il ceppo A3 / 02 identificato dai ricercatori svedesi nel 2013, sono in grado di ridurre le difese immunitarie di una persona molto più aggressivamente rispetto ai ceppi precedentemente noti.
Cosa sono l'HIV-1 e l'HIV-2?
Esistono due tipi di HIV: HIV-1 e HIV-2. L'HIV-1 è considerato il tipo predominante, rappresentando la stragrande maggioranza delle infezioni in tutto il mondo, mentre l'HIV-2 è molto meno comune e principalmente concentrato nelle regioni occidentali e dell'Africa centrale. Mentre entrambi questi tipi di HIV possono portare all'AIDS, l'HIV-2 è molto più difficile da trasmettere e molto meno virulento dell'HIV-1.
All'interno di ciascuno di questi tipi di HIV ci sono un certo numero di gruppi, sottotipi ("cladi") e sottotipi. Indubbiamente, altri sottotipi e ceppi ricombinanti saranno scoperti mentre la diffusione globale dell'HIV continua.
Gruppi e sottotipi di HIV-1
L'HIV-1 è diviso in quattro gruppi: Gruppo M (che significa "maggiore"); Gruppo O (che significa "outlier" o oltre il punto in cui sono visti altri gruppi); e gruppo N (che significa "non-M" e "non-O"); e gruppo P (che significa "in sospeso"). I quattro diversi gruppi sono classificati dai quattro diversi virus dell'immunodeficienza simian (SIV) che erano noti per essere passati da scimmie o scimpanzé all'uomo.
Gruppo HIV-1 M
Il gruppo HIV-1 M è stato il primo gruppo ad essere identificato e oggi rappresenta circa il 90% dei casi di HIV in tutto il mondo e può essere trovato virtualmente in ogni parte del pianeta. All'interno di questo gruppo ci sono 10 sottotipi, che possono essere stratificati, tra l'altro, sulla loro distribuzione geografica e sul loro impatto su diversi gruppi di rischio.

Sottotipo A: visto nell'Africa occidentale e che colpisce principalmente gli eterosessuali e gli utilizzatori di droghe iniettabili (IDU).
Sottotipo B: il sottotipo predominante in Europa, America, Giappone, Tailandia e Australia, che rappresenta quasi tutta l'infezione in Nord America e circa l'80% di tutto in Europa. Le infezioni si verificano in più tra gli uomini che hanno rapporti sessuali con uomini (MSM) e IDU rispetto agli eterosessuali.
Sottotipo C: descritto come il sottotipo di HIV più diffuso che rappresenta il 48% di tutte le infezioni in tutto il mondo, principalmente eterosessuali e principalmente nell'Africa subsahariana, in India e in alcune parti della Cina.
Sottotipo D: isolare principalmente nell'Africa orientale e centrale.
Sottotipo E: sottotipo visibile solo in una forma ricombinante con sottotipo A.
Sottotipo F: tra una percentuale minore di infezioni osservate in Africa centrale, Sud America e Europa.
Sottotipo G: tra una percentuale minore di infezioni osservate in alcune parti dell'Africa e dell'Europa.
Sottotipo H: tra una percentuale minore di infezioni osservate in Africa centrale.
Sottotipo J: osservato nell'Africa settentrionale, centrale e occidentale e nei Caraibi

Sottotipo K: limitato alla Repubblica Democratica del Congo (RDC) e al Camerun.

Gruppo HIV-1 O
Il gruppo HIV-1 O è stato scoperto nel 1990 e rappresenta solo l'1% delle infezioni in tutto il mondo. Questo gruppo di HIV è isolato in Camerun e nei paesi africani limitrofi.
Gruppo HIV-1 N
Il gruppo HIV-1 N è stato scoperto nel 1998 e, ancora, è stato visto solo in Camerun con meno di 20 casi documentati fino ad oggi.
Gruppo HIV-1 P
Il gruppo HIV-1 P è un tipo raro di HIV, identificato per la prima volta in una donna del Camerun nel 2009. Può essere differenziato da altri gruppi HIV in quanto le sue origini sono state collegate a una forma di SIV riscontrata nei gorilla occidentali. Sebbene la classificazione "P" intendesse inferire uno stato "pendente" (vale a dire, in attesa di conferma di ulteriori infezioni), nel 2011 un uomo camerunense ha identificato un secondo caso documentato.
Gruppi HIV-2
Sebbene i casi di HIV-2 siano stati identificati altrove, le infezioni sono quasi esclusivamente osservate in Africa. Ci sono attualmente otto gruppi HIV-2, sebbene solo i sottotipi A e B siano gli unici considerati epidemici. Si ritiene che l'HIV-2 abbia incrociato le specie di un tipo di SIV che colpisce il manigoldi fuligginosi scimmia direttamente agli umani.
Il Gruppo A dell'HIV-2 è visto principalmente in Africa occidentale, sebbene i viaggi internazionali abbiano portato a una manciata di casi documentati negli Stati Uniti, in Europa, in Brasile e in India. Al contrario, il gruppo B dell'HIV-2 è stato limitato a parti dell'Africa occidentale.